26 октября 1994 года приказом генерального директора и генерального конструктора ФГУП «КБОМ» № 168 для эксплуатации стартового комплекса пл.200 был создан Центр испытаний № 2.

Главное направление деятельности центра — обеспечение реализации задач Федеральной космической программы, программ международного космического сотрудничества и программ в интересах Министерства обороны Российской Федерации, связанных с использованием ракет-носителей «Протон» и её модификаций. На Байконуре прошли торжественное собрание и праздничный концерт, посвященные юбилею ЦИ-2. Ракетчиков поздравили заместитель директора филиала по наземной космической инфраструктуре и испытаниям Анатолий Карпук, технический руководитель по подготовке стартового комплекса филиала ФГУП «ЦЭНКИ» — НИИСК Илья Карягин, руководители структурных подразделений филиала и представители профсоюзной организации. В честь юбилея ЦИ-2 и за успехи, достигнутые при выполнении космических программ, ряд сотрудников были награждены памятным Знаком ФГУП «ЦЭНКИ» II степени, грамотами, благодарностями и ценными подарками от генерального директора ЦЭНКИ и директора филиала Космический центр «Южный». Кроме того, отличившимся работникам были присвоены звания «Заслуженный испытатель ФГУП «ЦЭНКИ». В настоящее время в состав центра входят: - два стартовых комплекса с тремя пусковыми установками для пусков ракет-носителей «Протон-М»; - монтажно-испытательные корпуса; - пусковые установки и технические позиции ракетных комплексов; - системы хранения углеводородных топлив и криогенных продуктов; - стартовый комплекс ракеты-носителя «Циклон», который находится в режиме хранения. Всего ЦИ-2 за 25 лет работы проведено 123 пуска ракет космического назначения. Наибольшее количество запусков было в 2000 году — 14 (из них в июле и в октябре — по 3 пуска).