The organic foods products are limited
20-часовое отключение после проблем с бортовым компьютером
Отказ системы охлаждения
Три отказа системы ориентации и стабилизации в течении года
Отказ СТР
Отказ БРТК
Два отказа КИС и БРТК
Отказ системы энергоснабжения. Полностью потерян
Как агентство Kyodo, причиной невыполнения штатной процедуры забора грунта 26 ноября 2005 г — ошибка в программе, заложенной с Земли в бортовой компьютер «Хаябусы» двумя днями ранее. Штатная процедура забора грунта предусматривала выстрел в грунт несколькими пульками и накопление выброшенного при ударе вещества астероида. В ходе исполнения этой программы была ошибочно активирована одна из защитных функций, которая и заблокировала «выстрел».
Аппарат осуществил ещё одну попытку забора грунта. В момент максимального сближения с поверхностью астероида произошел сбой компьютера. Аппарат потерял ориентацию и повредил один из двигателей, вскоре связь с ним была потеряна. Однако грунт удалось забрать. К марту 2006 года связь удалось восстановить.